Foi a primeira cientista a identificar a translocação
cromossómica como a causa da leucemia e de outros cancros.
Em 1984, Rowley tornou-se Blum-Riese Distinguished
Service Professor da Universidade de Chicago.
Em 1998, foi um dos três cientistas laureados com o Prémio
Lasker pelo seu trabalho sobre translocação e, no mesmo ano, recebeu a Medalha
Nacional de Ciências.
Em 2003, recebeu a Medalha Benjamin Franklin da
American Philosophical Society.
Em 2009, foi condecorada com a Medalha Presidencial
da Liberdade, a maior honra cívica dos Estados Unidos, e o Prémio Gruber
de Genética.
Rowley faleceu aos 88 anos de idade, devido a
complicações de um cancro ovariano.
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